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Secuencia del gen Pax6 expresada con luces

experimentos — Tags: , — alejandro @ May 29, 2011

He estado haciendo experimentos formales con la secuencia del gen Pax6. Este es el gen que detona la formación de ojos. Se ha encontrado que esta secuencia genética la compartimos con todas las demás especies animales que poseen ojos, desde moscas hasta ratones.

En el genoma humano se ha ubicado en el cromosoma 11 y tiene alrededor de 30,000 pares de bases. Buscando un poco en internet me encontré la secuencia completa.

Un día saliendo del taller de la maestría vi que alguien devolvía cuatro luces que prestan para los cursos de fotografía. Se me ocurrió asignar a cada una de ellas las cuatro bases del código. Entonces desarrollé un pequeño algoritmo en Python que se encarga de leer la secuencia completa del gen y por medio de un microcontrolador y relés encender cada luz de manera secuencial.

He explorado con diferentes intervalos de tiempo entre cada nucleótido llegando a parecerme más interesante un tiempo de 0.1 segundos entre cada par de bases. Con esta velocidad el gen termina de expresarse en aproximadamente una hora.

Este video muestra los primeros 20 segundos de esa secuencia:

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